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利用基因定序技術與大型基因體數據庫探討罕見遺傳疾病與複雜疾病之相關遺傳風險因子

為了解決msi gf63缺點的問題，作者林旻柔 這樣論述：

本研究分為兩大主題：一、運用大型基因體資料庫研究LAG3與複雜疾病之關係及其生理功能；二、運用基因定序技術探討罕見遺傳疾病之遺傳因子。淋巴球活化因子三 (LAG3)為ㄧ種免疫負調控蛋白，透過抑制T細胞的胞殺作用來維持免疫平衡，近年來被視為腫瘤免疫治療的新興潛力標靶。本研究透過TCGA與GEO等大型癌症基因資料研究LAG3於黑色素瘤的作用機制、找尋新穎藥物標靶，並利用臺灣人體生物資料庫研究LAG3的基因多效性，進一步探討抗LAG3藥物可能的副作用及瞭解LAG3如何影響人類的生理與疾病。首先，我們整合TCGA與GEO的資料，觀察LAG3基因表現與黑色素瘤患者臨床表徵及使用免疫抑制劑治療反應的相關

性。我們發現LAG3高表現顯著的與存活率相關，且LAG3與PD1表現量皆高的病人展現了最好的存活曲線。另外，我們發現了IL2RG與JAK3這兩個會和LAG3共同表達的基因可作為黑色素瘤的預後指標，而且IL2RG、JAK3、LAG3與PD1表現量皆高的病人比起單獨PD1表現量高的病人來說，對於抗PD1藥物治療有較有反應。除此之外，我們透過全表型組關聯研究，分析5個LAG3常見型基因變異與87個複雜疾病性狀的相關性，然而其中沒有顯著關聯。由於LAG3為免疫功能的重要基因，我們認為其突變不應輕易造成疾病。總結來說，我們的研究支援了合併使用免疫抑制劑的治療策略，且為黑色素瘤提供了新的潛力標靶。另一方面

，我們針對馬凡氏症候群與嚴重青少年原發性脊椎側彎兩種罕見疾病，分別進行全外顯子組測序，於臺灣族群中找尋各自之致病性突變位點。接著經由路徑分析瞭解目標基因的相關生物學功能、細胞組成及分子功能。最後利用DrugBank及Therapeutic Target Database，希冀找出能治療馬凡氏症侯群的藥物。馬凡氏症侯群為一種體染色體顯性遺傳性結締組織疾病，除了骨骼細長、視力差外，患者多伴隨心臟疾病。臨床上的治療包含預防性心臟手術或使用藥物控制症狀，然而其效果有限。國外已有研究顯示FBN1, TGFBR1及TGFBR2基因突變會導致病人罹病，然而針對臺灣族群之馬凡氏症侯群尚未有詳細的基因變異被報導

過。在本研究中，我們在臺灣族群中驗證了FBN1與馬凡氏症候群之因果關係，並且發現TTN與POMT1為重要的新穎致病基因。針對家族病人，我們發現了八個位在不曾被報導過的基因上的致病性位點。此外，我們認為Perindopril具有潛力作為馬凡氏症侯群的治療藥物，值得後續深入研究。青少年原發性脊椎側彎好發於青少年時期，其嚴重患者之Cobb’s angle彎曲角度常大於四十度，且容易伴有嚴重併發症。我們在嚴重青少年原發性脊椎側彎患者身上找到了一百多個致病性位點，且幾乎都只由單一個病人所帶有，意指這些位點並不共享於病人中。其中根據路徑分析結果，我們認為TTN與CLCN1為最重要之致病基因。綜合以上，嚴重

青少年原發性脊椎側彎為一種多基因所調控的疾病，且需要收更多有家族關係的病人以研究其中的遺傳模式。

熱帶地區內陸水域大氣校正神經網絡使用 Landsat 8衛星影像

為了解決msi gf63缺點的問題，作者羅氏鶯 這樣論述：

水體遙感反射率的擷取值是使用衛星遙感技術進行水質監測的一個基本且重要的步驟。大氣影響通常顯著而複雜，使得大氣校正（ACs）難以準確得出地表反射率。輻射傳輸模式是大氣校正很有前途的方法之一。然而，該方法需要使用複雜的模型計算包含氣溶膠模型、大氣條件和感測器的幾何資訊等參數，因此相當耗費時間，有時甚至會因鄰近效應、雲的陰影和氣溶膠的過度校正產生負的水體遙感反射率。因此本研究提出基於卷積和全連接神經網路的大氣校正網路—AC-Net，利用Landsat 8 OLI影像擷取熱帶地區內陸水體的遙感反射率。為了訓練AC-Net，神經網路選擇採用現有大氣校正模型所生成的遙感反射率作為訓練資料。現有的大氣校正

模型當中，iCOR因考量目標區域周圍物體造成的相鄰效應，為有前途的輻射傳輸模型，故本研究所提出的模型將透過iCOR產生AC-Net模型所需的訓練資料，使AC-Net可直接透過神經網路，將頂層大氣反射率、幾何角度和氣溶膠光學厚度等輸入資料直接輸出成遙感反射率。AC-Net亦使用現地資料進行驗證並測試其他湖泊的數據，評估模型的可行性與有效性。實驗中AC-Net與其他常用模型進行比較，包括暗體辨識法（DOS）、快速大氣校正（QUAC）、ACOLITE大氣校正、嚴謹大氣校正（FLAASH）、LaSRC演算法和iCOR，並透過均方根誤差（RMSE）、偏差（BIAS）和平均絕對百分比誤差（MAPE）評估大

氣校正模型的性能。結果顯示AC-Net的RMSE為0.004，偏差為0.0005，MAPE為4.19，性能表現優於其他常用模型。此外AC-Net能避免產生負的遙感反射率，並且適用於熱帶地區的內陸水體。關鍵字：大氣校正、遙感反射率、類神經網路、Landsat 8 OLI影像