DNA sequencing appli的問題，透過圖書和論文來找解法和答案更準確安心。 我們找到下列懶人包和總整理

高鹽甲烷太古生物Methanohalophilus portucalensis FDF1T離胺酸2,3胺基異位酵素之特性分析

為了解決DNA sequencing appli的問題，作者巫宜珊 這樣論述：

高鹽甲烷古菌Methanohalophilus portucalensis FDF1T會隨著胞外鹽濃度提升，在細胞內會累積鉀離子、glycine betaine、β-glutamate、β-glutamine以及Nε-acetyl-β-lysine等溶質作為相容質來維持細胞膨壓並保護胞內酵素維持細胞正常生理代謝。β型胺基酸Nε-acetyl-β-lysine證實在所有甲烷古菌(含極端高溫與低鹽等)均扮演相容質角色。Nε-acetyl-β-lysine生合成途徑是由α-lysine經lysine 2,3-aminomutase (AblA)作用轉為β-lysine，再經由β-lysine ac

etyltransferase (AblB)作用生合成Nε-acetyl-β-lysine。總基因體分析顯示甲烷古菌FDF1T具有兩套ablA基因。ablA1與其共轉錄的ablB是相容質Nε-acetyl-β-lysine生合成基因；而ablA2基因的上下游皆為轉譯相關蛋白，且不具有ablB基因。細菌以lysine 2,3-aminomutase (YjeK)生成的β-lysine，會藉由lysyl-tRNA synthetase (PoxA)將β-lysine連結到核醣體的延長因子(EF-P)，參與後轉譯修飾調控，因此推測ablA2可能與細菌的YjeK相似，參與β-lysylation修飾調

控。親緣關係樹狀圖分析顯示甲烷古菌的ablA2基因可能由ablA1基因演化而來，再平行轉移至Deltaproteobacteria等細菌。AblA2與AblA1氨基酸序列相似度為41%，均具有參與催化活性的輔因子: [4Fe-4S] cluster、S-adenosylmethionine (SAM)、pyridoxal 5’-phosphate (PLP)的高度保守性胺基酸鍵結位置，不同的是AblA2沒有鋅的鍵結位置。甲烷太古生物的AblA蛋白是β-型胺基酸生成酵素，對藥物開發具重要性及具有潛力。利用E. coli BL21 (DE3) RIL異源大量表現MpAblA1，使用添加dihydr

olipoic acid與sodium dithionite還原劑的buffer使MpAblA1蛋白維持還原狀態，以超高壓液相層析儀分析酵素產物β-lysine。活性分析結果顯示MpAblA1具有將α-lysine轉換生成β-lysine的功能，MpAblA1於37℃、pH 8.0環境之下，在0.075~0.3 mM α-lysine受質濃度時，受質α-lysine濃度與產物β-lysine生成量及反應速率呈正比(一級反應)。以雙倒數作圖(Lineweaver-Burk)推算出來最大反應速率Vmax為103.09 nmole/min，對α-lysine的親和性為2.41 mM，期能大量生產β-

型胺基酸應用於新藥研發。

表面增強拉曼光譜技術於臨床微生物的分析應用

為了解決DNA sequencing appli的問題，作者韓吟宜 這樣論述：

臨床微生物檢驗技術的發展一直都是因應臨床上的需求而行。當今各種傳染病的發生率上升，尤其是敗血症，嚴重地威脅人類的健康。儘早給予適當的抗生素是爭取生存的關鍵。然而，現今的微生物分析法多以費時的培養步驟為基礎，並無法即時提供微生物分析結果來指引早期的抗生素選擇。濫用或過度地使用抗生素，不僅會導致患者的高死亡率，而且造成抗藥性細菌的普遍性，這是顯然是另一種醫療災難。在近年新發展的快速微生物分析法中，表面增強拉曼光譜能提供專一性的分子結構鑑定，且已經能夠檢測並定量極低濃度的待測分子，極有潛力成為快速且具高敏感性及專一性的微生物分析方法。 在本研究中，我們建立了以表面增強拉曼光譜技術作為平台的臨

床微生物分析法。在研究前期，我們找到了細菌特定的表面增強拉曼光譜生物標記，分別可適用於革蘭氏陽性和陰性細菌來作為他們對於抗生素敏感性試驗的指標。我們將此方法應用於標準菌株以及已繼代多次的臨床分離菌株上，發現此以表面增強拉曼散射技術所進行的藥物敏感性檢測結果與現行的微生物檢測標準方法相較，結果一致。在進階研究中，我們另外發展出一套有效率的臨床菌血檢體的處理流程。在去除了臨床血液檢體中的複雜干擾後，此方法一樣能得到與黃金標準方法相同的藥物敏感性檢測結果。